Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOR4AQ9NXH8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOR4AQ9NXH8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOR4AQ9NXH8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TOR4AQ9NXH8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms