Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC3Q9NUD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC3Q9NUD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC3Q9NUD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms