Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RRP7BPQ9NSQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRP7BPQ9NSQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
RRP7BPQ9NSQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RRP7BPQ9NSQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms