Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPMQ9NSP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPMQ9NSP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPMQ9NSP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms