Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOMER3Q9NSC5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOMER3Q9NSC5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOMER3Q9NSC5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms