Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CNNM1Q9NRU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CNNM1Q9NRU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNNM1Q9NRU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms