Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF3Q9NRP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHAF3Q9NRP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF3Q9NRP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms