Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYLDQ9NQC7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYLDQ9NQC7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms