Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRD7Q9NPI1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD7Q9NPI1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD7Q9NPI1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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