Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM138Q9NPI0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM138Q9NPI0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM138Q9NPI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms