Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZDHHC4Q9NPG8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC4Q9NPG8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC4Q9NPG8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZDHHC4Q9NPG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms