Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2TQ9NPD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE2TQ9NPD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE2TQ9NPD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2TQ9NPD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2TQ9NPD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2TQ9NPD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms