Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC21

SLC25A19, Mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A19Q9HC21 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A19Q9HC21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A19Q9HC21 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A19Q9HC21 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A19Q9HC21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A19Q9HC21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A19Q9HC21 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A19Q9HC21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC25A19Q9HC21 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A19Q9HC21 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms