Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG4Q9H9E3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG4Q9H9E3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG4Q9H9E3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms