Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATSPERBQ9H7T0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CATSPERBQ9H7T0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms