Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7M6

ZSWIM4, Zinc finger SWIM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM4Q9H7M6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZSWIM4Q9H7M6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSWIM4Q9H7M6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZSWIM4Q9H7M6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM4Q9H7M6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms