Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM38AQ9H6F2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM38AQ9H6F2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms