Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLMPQ9H6B4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLMPQ9H6B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLMPQ9H6B4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLMPQ9H6B4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms