Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRN3Q9H3W5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRN3Q9H3W5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms