Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6CQ9H3T2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6CQ9H3T2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA6CQ9H3T2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms