Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTBN4Q9H254 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN4Q9H254 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN4Q9H254 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN4Q9H254 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN4Q9H254 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms