Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHARPINQ9H0F6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHARPINQ9H0F6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHARPINQ9H0F6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms