Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ8

LACRT, Extracellular glycoprotein lacritin, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACRTQ9GZZ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LACRTQ9GZZ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LACRTQ9GZZ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LACRTQ9GZZ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LACRTQ9GZZ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms