Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NIF3L1Q9GZT8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NIF3L1Q9GZT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIF3L1Q9GZT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NIF3L1Q9GZT8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms