Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A8Q9C0K1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A8Q9C0K1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A8Q9C0K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A8Q9C0K1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 693.6 ms