Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRRCC1Q9C099 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRCC1Q9C099 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRCC1Q9C099 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRCC1Q9C099 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms