Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
INO80BQ9C086 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80BQ9C086 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INO80BQ9C086 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms