Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM6Q9C030 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM6Q9C030 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM6Q9C030 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 717.1 ms