Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM31Q9BZY9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM31Q9BZY9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM31Q9BZY9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM31Q9BZY9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms