Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5DQ9BY66 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5DQ9BY66 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM5DQ9BY66 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM5DQ9BY66 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM5DQ9BY66 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM5DQ9BY66 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms