Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PECRQ9BY49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PECRQ9BY49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PECRQ9BY49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms