Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1QTNF3Q9BXJ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QTNF3Q9BXJ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms