Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTDSS2Q9BVG9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS2Q9BVG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTDSS2Q9BVG9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms