Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAMP8Q9BV40 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAMP8Q9BV40 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.4 ms