Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCMBPQ9BTE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCMBPQ9BTE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCMBPQ9BTE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms