Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GORASP1Q9BQQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GORASP1Q9BQQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GORASP1Q9BQQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms