Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C19orf43Q9BQ61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf43Q9BQ61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C19orf43Q9BQ61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C19orf43Q9BQ61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms