Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS3Q9BQ31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms