Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRRT1Q99946 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PRRT1Q99946 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PRRT1Q99946 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRRT1Q99946 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms