Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRRX2Q99811 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRRX2Q99811 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRX2Q99811 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms