Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPAS1Q99742 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPAS1Q99742 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS1Q99742 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms