Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP4Q99727 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP4Q99727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP4Q99727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP4Q99727 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms