Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIGMAR1Q99720 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIGMAR1Q99720 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms