Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX2Q99697 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITX2Q99697 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITX2Q99697 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITX2Q99697 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.6 ms