Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDHCQ99643 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDHCQ99643 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHCQ99643 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHCQ99643 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SDHCQ99643 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms