Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A3Q99624 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC38A3Q99624 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A3Q99624 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A3Q99624 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms