Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAT1Q99536 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAT1Q99536 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1Q99536 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAT1Q99536 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms