Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L3Q99457 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L3Q99457 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NAP1L3Q99457 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms