Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CPXM1Q96SM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPXM1Q96SM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPXM1Q96SM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPXM1Q96SM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms