Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NODALQ96S42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NODALQ96S42 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NODALQ96S42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NODALQ96S42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms